Rapport canadien de surveillance des virus respiratoires: Laboratoire

Les données proviennent du Système de surveillance de la détection des virus respiratoires (SSDVR). Le SSDVR recueille le nombre de tests et de détections positives de 8 virus respiratoires provenant de laboratoires partout au Canada. Les données de ce rapport sont mises à jour tous les jeudis. La dernière mise à jour de cette page a eu lieu le 10 août 2023, à 10 h (HE), avec des données allant jusqu'au ... inclusivement (semaine de surveillance ...).

Sur cette page

• Faits saillants
• Tendances hebdomadaires au fil du temps
• Tendances géographiques
• Activités hebdomadaires passées et actuelles
• Tableaux de test et de détection
• Explorer les données
• Comprendre les données

Faits saillants  pour la semaine se terminant le (semaine )

Résumé des données de laboratoire nationales sur les virus respiratoires

Tendances hebdomadaires au fil du temps

Figure 1 : au Canada au Région de l’Atlantique     en Terre-Neuve-et-Labrador     dans L’Île-du-Prince-Édouard     en Nouvelle-Écosse     au Nouveau-Brunswick au Québec en Ontario dans les Prairies     au Manitoba     au Saskatchewan     en Alberta en Colombie-Britannique dans les Territoires du Canada     au Yukon     dans les Territoires du Nord-Ouest     au Nunavut par semaine de surveillance, saison .

Figure 1 : Texte descriptif

Guide de données

• Utilisez les commandes pour sélectionner une région du Canada et une mesure de l’activité du virus respiratoire à afficher. Sélectionnez des virus pour comparer les tendances dans la région tout au long de la saison actuelle des virus respiratoires. Survolez ou appuyez sur la figure pour afficher les valeurs et les dates hebdomadaires.

Remarques sur les données

• Les virus respiratoires autres que le SRAS-CoV-2 ne sont présentés qu’aux niveaux régional et national. Il est à noter que certaines régions ne font pas de tests ou de rapports sur tous les virus du SSDVR
• Les estimations hebdomadaires du pourcentage de positivité sont supprimées (non indiquées) pour les Territoires du Nord-Ouest lorsque le nombre de tests de dépistage de la COVID-19 déclarés est inférieur à 45. Pour de petits nombres comme celui-ci, il est difficile de fournir une estimation hebdomadaire exacte du pourcentage de positivité.

Tendances géographiques

Figure 2 : {Sélectionner un virus :} {Sélectionner un virus :} par province, territoire ou région pour la semaine se terminant le ...

Figure 2 : Texte descriptif

Guide de données

• Utilisez les commandes pour sélectionner un virus et une mesure de l’activité du virus respiratoire. La carte affiche les données sélectionnées pour la semaine de surveillance la plus récente, présentant une comparaison géographique de la situation actuelle. Survolez ou appuyez sur des zones pour afficher les tendances au fil du temps.

Remarques sur les données

• Les provinces et territoires peuvent utiliser différentes pratiques de dépistage, ce qui peut avoir une incidence sur des indicateurs comme le pourcentage de tests positifs. Veuillez interpréter les données avec prudence.
• Les virus respiratoires autres que le SRAS-CoV-2 ne sont présentés qu’aux niveaux régional et national. Il est à noter que certaines régions ne font pas de tests ou de rapports sur tous les virus du SSDVR
• Les estimations hebdomadaires du pourcentage de positivité sont supprimées (non indiquées) pour les Territoires du Nord-Ouest lorsque le nombre de tests de dépistage de la COVID-19 déclarés est inférieur à 45. Pour de petits nombres comme celui-ci, il est difficile de fournir une estimation hebdomadaire exacte du pourcentage de positivité.

Activités hebdomadaires passées et actuelles

Figure 3 : Pourcentage de tests positifs par semaine de surveillance, comparaison des saisons récentes des virus respiratoires.

Figure 3 : Texte descriptif

Guide de données

• Ces chiffres comparent le pourcentage hebdomadaire national de tests positifs au cours des dernières saisons des virus respiratoires. Utilisez les contrôles pour sélectionner les virus et les saisons à des fins de comparaison. Utilisez les boutons d’échelle pour sélectionner si tous les chiffres doivent avoir la même échelle (fixe) ou si l’échelle de chaque figure est ajustée pour s’adapter à certaines données (dynamique).
• Survolez un chiffre ou appuyez dessus pour afficher les valeurs et les dates hebdomadaires. Veuillez noter que les dates ne sont présentées que pour la saison en cours. Les données sont harmonisées d’une saison à l’autre par semaine de surveillance; ces semaines ne comprennent pas exactement les mêmes jours de l’année d’une saison à l’autre, mais elles ne diffèrent pas de plus de 7 jours. Pour de plus amples renseignements, veuillez consulter les remarques techniques.

Remarques sur les données

• Les pratiques de dépistage sont susceptibles de changer avec le temps, ce qui peut affecter des indicateurs tels que le pourcentage de tests positifs. Les comparaisons directes entre les saisons doivent être faites avec prudence.
• Le SSDVR a intégré la surveillance du SRAS-CoV-2 au début de la saison 2022-2023. Aucune donnée antérieure n’est disponible à des fins de comparaison historique.

Tableaux de test et de détection

Tableau 1 : Tests et détections positives de virus respiratoires pour la , par pour la

Guide de données

• Utilisez les commandes pour afficher plus en détail les données de test et de détection en laboratoire pour certains virus respiratoires. Les données peuvent être consultées par le laboratoire de déclaration ou le niveau auquel les données sont déclarées au SSDVR. Elles peuvent aussi être agrégées et consultées par province, territoire ou région. Sélectionnez une semaine de surveillance et choisissez de consulter les données pour la semaine de surveillance sélectionnée ou de consulter les totaux de la saison jusqu’à cette semaine.
• Ajustez le tableau en sélectionnant des virus et en utilisant le filtre pour sélectionner des laboratoires de déclaration spécifiques que vous souhaitez afficher.

Remarques sur les données

• Les données représentent les données de surveillance disponibles au moment de l’analyse. Les retards dans la disponibilité et la déclaration des données peuvent entraîner une modification rétrospective des données.
• « S/O » signifie que certaines données ne sont pas disponibles. Les données peuvent être indisponibles si elles n’ont pas été déclarées pour la semaine de surveillance en cours. Par ailleurs, les données peuvent être indisponibles si un laboratoire de déclaration ne recueille pas ou ne déclare pas de données pour des virus particuliers.
• Certains laboratoires de santé publique au Canada font du sous-typage d’échantillons de grippe provenant d’autres laboratoires. Une fois identifiées, ces détections de sous-types ne sont pas incluses dans le nombre total de détections de la grippe A; dans ces cas, le nombre total de détections de la grippe A peut ne pas correspondre à la somme des détections de sous-types de la grippe A. Le nombre total de cas positifs de grippe A et B est utilisé pour calculer le pourcentage de cas positifs.
• Les résultats de la Colombie-Britannique comprennent des spécimens des sites suivants: Children's and Women's Hospital Laboratory, Fraser Health Medical Microbiology Laboratory, Island Health, Providence Health Care, Vancouver Coastal Health sites, Victoria General Hospital, BCCDC Public Health Laboratory, Interior Health Authority sites et Northern Health Authority sites.
• Abréviations :
  • A(H1N1)pdm09 : Grippe A(H1N1)pdm09
  • A(H3) : Grippe A(H3N2)
  • A(NonS) : Grippe A(non sous-typé)
  • ALREO : L'Association des laboratoires régionaux de l'Est de l'Ontario
  • S/O : Sans objet
  • SPOL : Santé publique Ontario (Laboratoire)
  • UHN : University Health Network

Explorer les donneés

Figure 4 : , stratifiées par , échelle

Figure 4 : Texte descriptif

Guide de données

• Utilisez les contrôles pour explorer les données de la saison en cours. Explorez les mesures de l’activité des virus respiratoires et comparez les mesures par virus ou par région.
• Sélectionnez les régions et les virus que vous souhaitez afficher. Utilisez les commandes pour afficher les chiffres séparés par région ou séparés par virus.
• Sélectionnez la mesure de l’activité du virus respiratoire que vous souhaitez afficher et sélectionnez si toutes les figures doivent avoir la même échelle (fixe) ou si l’échelle de chaque figure est ajustée pour correspondre aux données (dynamique).

Remarques sur les données

• Les provinces et territoires peuvent utiliser différentes pratiques de dépistage, ce qui peut avoir une incidence sur des indicateurs comme le pourcentage de tests positifs. Veuillez interpréter les données avec prudence.

Comprendre les données

Dans cette section

• Abréviations
• Source de données
• Utilisation des données
• Remarques techniques

Abréviations

A(H1N1)pdm09

Grippe A(H1N1)pdm09

A(H3)

Grippe A(H3N2)

A(NonS)

Grippe A(non sous-typé)

ADV

Adénovirus

ALREO

L'Association des laboratoires régionaux de l'Est de l'Ontario

COVID-19

Maladie à coronavirus 2019

EV/RV

Entérovirus/Rhinovirus

HCoV

Coronavirus humain 229E/OC43/NL63/HKU1

MPVH

Métapneumovirus humain

S/O

Sans objet

SPOL

Santé publique Ontario (Laboratoire)

SRAS-CoV-2

Coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère 2

SSDVR

Système de surveillance de la détection des virus respiratoires

UHN

University Health Network

VPIH

Virus parainfluenza humain

VRS

Virus respiratoire syncytial

Source de données

Les données sont recueillies au moyen du Système de surveillance de la détection des virus respiratoires (SSDVR). Le SSDVR est un système de surveillance de laboratoire de longue date auquel les laboratoires de santé publique provinciaux, territoriaux et régionaux ainsi que certains laboratoires hospitaliers participent. Il y a des laboratoires de déclaration dans toutes les provinces et tous les territoires, mais ce ne sont pas tous les tests de dépistage de virus respiratoires au Canada qui sont saisis dans le SSDVR. Les laboratoires déclarent des données pour jusqu’à 8 virus respiratoires :

• SRAS-CoV-2 (le virus à l’origine de la COVID-19)
• Grippe
• Virus respiratoire syncytial (VRS)
• Virus parainfluenza humain
• Adénovirus
• Métapneumovirus humain
• Entérovirus/rhinovirus
• Coronavirus humain 229E/OC43/NL63/HKU1 (ne comprend pas le SRAS-CoV-2)

Les laboratoires effectuent des tests moléculaires de ces virus et ils déclarent le nombre de tests et de détections positives de chaque virus toutes les semaines pendant l’année.

La plupart des tests sont effectués sur :

• des cas d’infection respiratoire aiguë dans les services d’urgence
• des cas d’hospitalisation de virus respiratoire aigu sévère
• des cas liés à une éclosion

Les patients externes présentant des symptômes d’infection à un virus respiratoire peuvent faire l’objet d’un test, mais les tests sont généralement limités aux personnes à risque élevé. Les algorithmes d’analyse respiratoire varient selon la province ou le territoire.

Utilisation des données

Les données de laboratoire soumises au SSDVR sont l’un des principaux éléments de surveillance de l’activité des virus respiratoires au Canada. Le pourcentage hebdomadaire de tests positifs (aussi appelé pourcentage de positivité) est le principal indicateur utilisé pour évaluer les tendances de la transmission du virus respiratoire au fil du temps et selon le lieu. Cet indicateur est calculé à partir des données soumises au SSDVR, comme suit :

$\mathrm{Pourcentage\; hebdomadaire\; de\; tests\; positifs\; (\%)}=\frac{\mathrm{Nombre\; de\; détections\; positives\; en\; une\; semaine}}{\mathrm{Nombre\; de\; tests\; en\; une\; semaine}}x\; 100\%$

Les données sur la grippe soumises par l’entremise du SSDVR sont également résumées dans les rapports hebdomadaires sur l’influenza (ÉpiGrippe) ainsi que dans les rapports annuels et de mi-saison sur la grippe. Les données sur le pourcentage de positivité dans le SSDVR sont utilisées pour déterminer le début et la fin des épidémies saisonnières de grippe.

Les données de laboratoire du SSDVR servent également à satisfaire aux responsabilités internationales du Canada en matière de surveillance des virus respiratoires. Chaque semaine, nous soumettons des données agrégées au système RespiMart de l’Organisation mondiale de la Santé (OMS) et à l’Organisation panaméricaine de la Santé (OPS) aux fins d’inclusion dans leurs rapports de situation hebdomadaires sur les virus respiratoires.

Pour de plus amples renseignements, veuillez consulter :

• Rapport hebdomadaire sur l’influenza (ÉpiGrippe)
• Rapports annuels sur la grippe (ÉpiGrippe)
• RespiMart (OMS, en anglais seulement)
• Mises à jour du Programme mondial de surveillance de la grippe (OMS, en anglais seulement)
• Grippe, SRAS-CoV-2, VRS et autres virus respiratoires (OPS, en anglais seulement)

Remarques techniques

Les données du présent rapport représentent les données de surveillance disponibles au moment de l’analyse. Les retards dans la disponibilité et la déclaration des données peuvent entraîner une modification rétrospective des données.

Certains tests de dépistage de virus respiratoires au Canada ne sont pas saisis dans le SSDVR.

Les données sont agrégées selon les semaines de surveillance dans le SSDVR. Il est ainsi possible de comparer les données actuelles aux données historiques. Les semaines de surveillance commencent le dimanche et se terminent le samedi suivant.

Ce rapport ne présente que des données détaillées pour la saison actuelle des virus respiratoires. La surveillance pour chaque saison de virus respiratoire commence à la semaine 35 d’une année civile et se termine à la semaine 34 de l’année civile suivante. Cette période d’un an commence et se termine vers la fin d’août. Des données détaillées sur les saisons antérieures des virus respiratoires peuvent être consultées dans la section des archives du présent rapport.

• Calendrier des semaines de surveillance (saison en cours)
• Archives des rapports sur les virus respiratoires

Le SSDVR a intégré la surveillance du SRAS-CoV-2 au début de la saison 2022-2023. Aucune donnée antérieure n’est disponible à des fins de comparaison historique.

Les différences dans les indicateurs du SSDVR entre les administrations peuvent refléter des différences dans les algorithmes de dépistage et les rapports, ainsi que des différences réelles dans l’activité virale. Veuillez faire preuve de prudence lorsque vous comparez des indicateurs entre les administrations. Le dépistage du SRAS-CoV-2 et les différences de déclaration étaient les plus importantes lorsque le SRAS-CoV-2 a été inclus pour la première fois dans le SSDVR, mais ces différences devraient diminuer avec le temps.

S/O est utilisé pour désigner les données qui ne sont pas disponibles. Les données peuvent être indisponibles si elles n’ont pas été déclarées pour la semaine de surveillance en cours. Par ailleurs, les données peuvent être indisponibles si un laboratoire de déclaration ne recueille pas ou ne déclare pas de données pour des virus particuliers.

Les évaluations des tendances des virus respiratoires (augmentation/diminution/stabilité) sont actuellement basées sur une interprétation par les experts en la matière de l'ASPC des changements d'une semaine à l'autre des détections de virus respiratoires en laboratoire et des pourcentages de positivité. Des seuils fixes pour l'évaluation des tendances sont actuellement en cours de développement.

Sauf indication contraire, le terme grippe comprend les détections positives de la grippe A et de la grippe B.

Certains laboratoires de santé publique au Canada font du sous-typage d’échantillons de grippe provenant d’autres laboratoires. Une fois identifiées, ces détections de sous-types ne sont pas incluses dans le nombre total de détections de la grippe A; dans ces cas, le nombre total de détections de la grippe A peut ne pas correspondre à la somme des détections de sous-types de la grippe A. Le nombre total de cas positifs de grippe A et B est utilisé pour calculer le pourcentage de cas positifs.

Les changements apportés aux pratiques de dépistage pendant la pandémie de COVID-19 ont entraîné des changements aux indicateurs dans le SSDVR (aussi appelés « mesures de l’activité du virus respiratoire »). Le nombre de tests et de détections positives a augmenté en raison des volumes de tests plus élevés. Le pourcentage de tests positifs est probablement biaisé à la baisse en raison de l’ajout du SRAS-CoV-2 à l’ensemble de tests. En raison de ces changements, les données saisonnières antérieures à la pandémie de COVID-19 ne sont pas présentées dans ce rapport.