Rapport canadien de surveillance des virus respiratoires: COVID-19

Les niveaux d’activité de la COVID-19 se fondent sur les données fournies par les partenaires provinciaux et territoriaux (PT). Les niveaux nationaux d’activité de la COVID-19 ont été établis en consultation avec des partenaires PT pour suivre l’activité de la COVID-19 à l’échelle nationale ainsi que provinciale et territoriale à l’aide d’un ensemble normalisé d’indicateurs de base. Selon ces indicateurs, le niveau d’activité de la COVID-19 est classé de 0 (aucune activité) à 4 (activité élevée). La variation globale (hausse, baisse, aucune variation) par rapport à la semaine précédente est indiquée.

Indicateurs : Le niveau d’activité global de la COVID-19 est évalué en fonction des indicateurs suivants, le cas échéant :

1. Pourcentage hebdomadaire de positivité
   • Nombre hebdomadaire de tests de laboratoire positifs / Nombre total hebdomadaire de tests x 100.
   • Remarque : Cet indicateur est intégré dans l’évaluation globale seulement si le taux de dépistage est supérieur ou égal à 100 tests pour 100 000 habitants par semaine. L’indicateur est utilisé pour fournir des renseignements sur le niveau d’activité global et la trajectoire.
2. Éclosions hebdomadaires dans les établissements de soins de longue durée (ESLD) pour 1 000 000 habitants
   • Nombre hebdomadaire d’éclosions dans les ESLD / Population totale de l’administration x 1 000 000.
   • Remarque : L’indicateur est utilisé pour fournir des renseignements sur le niveau d’activité global et la trajectoire.
3. Trajectoire hebdomadaire de la COVID-19 dans les eaux usées
   • Trajectoire des niveaux hebdomadaires du virus de la COVID-19 dans les eaux usées par rapport à la semaine précédente.
   • Remarque : L’indicateur est utilisé uniquement pour fournir des renseignements sur la trajectoire globale.

Processus d’évaluation :

• Chaque indicateur se voit attribuer un niveau allant d’« aucune activité détectée » (niveau 0) à « activité très élevée » (niveau 4) selon des seuils normalisés (hausse, baisse ou aucune variation).
• Un niveau d’activité global est ensuite établi d’après le niveau moyen des indicateurs disponibles (arrondi au nombre entier le plus proche).
• La trajectoire globale, ou le sens du changement (fondé sur une variation de 10 % par rapport à la semaine précédente), est établie selon la direction des trajectoires des indicateurs disponibles.

Mises en garde au sujet de l’évaluation des données :

• Ces renseignements sont fondés sur les données fournies par des partenaires PT. Pour consulter des renseignements à jour, les recommandations de santé publique et les évaluations des risques, reportez-vous aux sites Web des partenaires PT.
• Les variations hebdomadaires dans les tests effectués et les éclosions au sein des ESLD reflètent les changements dans les chiffres entre la fin de la plus récente semaine épidémiologique et la fin de la semaine épidémiologique précédente. Les données sont mises à jour en permanence et peuvent changer.
• Les pratiques en matière de dépistage des partenaires PT, les sources de données et les rapports à l’ASPC varient d’une administration à l’autre.
• L’activité de la COVID-19 peut varier au sein d’une province ou d’un territoire. Il est possible que des éclosions survenues dans une région se traduisent par une hausse de l’activité de la COVID-19. Les évaluations hebdomadaires du niveau d’activité visent à fournir un aperçu général de la propagation de la COVID-19 à l’échelle nationale et PT. Il se peut qu’elles ne reflètent pas la véritable étendue de la propagation géographique de la COVID-19.

De nombreux variants font l’objet d’un suivi au Canada et dans le monde. Certains variants sont classés dans les catégories suivantes :

• Variant sous surveillance
  • fait l’objet d’une surveillance afin d’évaluer ses mutations et ses caractéristiques
• Variant d’intérêt
  • présente des mutations ou des caractéristiques d’intérêt et fait l’objet d’une surveillance pour déterminer s’il comporte un risque important pour la santé publique
• Variant préoccupant
  • présente des mutations et des caractéristiques qui sont importantes pour la santé publique

Pour obtenir des définition illées, consultez Variants du SRAS-CoV-2 : Définitions, désignations et mesures de santé publique nationales.

Il arrive qu’une personne soit infectée par 2 variants différents en même temps. Les variants peuvent alors échanger des fractions de leur matériel génétique pour former un variant hybride, aussi appelé « virus recombinant ». Ces virus héritent des propriétés de chacun des virus parents, ce qui peut modifier le comportement du virus. Les variants mentionnés ci-dessous dont le nom scientifique commence par la lettre « X » sont des variants recombinants (par exemple, XBB.1).

Certains virus évoluent rapidement, entraînant l’émergence de nombreux variants au fil du temps. Pour simplifier le suivi, les variants sont regroupés en lignées (variants partageant un ancêtre commun récent). Par exemple, le variant BA.1 (sous-variant original d’Omicron) a créé plusieurs lignées telles que BA.1.1 et BA.1.1.1.

Depuis mars 2023, l’Organisation mondiale de la Santé (OMS) attribue des lettres grecques uniquement aux variants préoccupants. Les variants d’intérêt et les variants sous surveillance sont désignés à l’aide des systèmes de nomenclature scientifique en vigueur. Il n’y a actuellement aucun variant préoccupant en circulation au Canada, car Omicron a fait l’objet d’une « désescalade ».

Un variant fait l’objet d’une « désescalade » lorsqu’il apparaît clairement qu’il ne présente pas un risque élevé pour la population ou qu’il est remplacé par de nouveaux variants.

Ventilation par semaine des cas causés par des variants

Remarque : Les colonnes ombrées à droite représente une période d'accumulation de données.

* Englobe toutes les lignées descendantes, sauf indication contraire.

† Des données supplémentaires sont nécessaires pour estimer avec plus de certitude la croissance et la proportion de cette lignée.

• Important : Lors de l’émergence d’une nouvelle lignée, les niveaux de détection sont trop faibles pour que la lignée soit incluse dans le modèle de prévision immédiate. Une fois la lignée prise en compte, les données demeurent limitées au départ, et la croissance et la proportion globale sont estimées de manière moins fiable. Au fur et à mesure que les données s’accumulent, l’exactitude et la précision des prévisions s’améliorent et l’intervalle de prévision diminue. Pendant les périodes de ralentissement de la collecte de données, les proportions globales peuvent être faussées et les prévisions, moins précises. Dans ces conditions, il convient d’interpréter les projections du modèle avec prudence.
• La collecte, le séquençage et le traitement des génomes viraux prennent du temps, il faut donc souvent prévoir 2 à 3 semaines pour le traitement des données. Nous utilisons un modèle de prévision immédiate pour estimer les proportions des variants pendant cette période.
• Les 8 premières semaines de la figure reflètent les données réelles de la base de données génomiques nationale. Les 2 dernières semaines sont des estimations basées sur le modèle de prévision immédiate. La prévision immédiate utilise des modèles statistiques pour évaluer la situation actuelle en fonction des tendances antérieures. Elle fournit des estimations pour les dernières semaines lorsque les données sont encore recueillies et donc incomplètes.
• Les valeurs numériques pour chaque lignée sont indiquées dans la légende et sont accompagnées d’intervalles de prévision. Un intervalle de prévision est une plage de valeurs (par exemple, de 16 à 19 %) qui indique le niveau de confiance de chaque estimation. Plus l’intervalle est petit, plus la certitude quant à la précision de la prévision est grande.