Programme de surveillance des antimicrobiens gonococciques (PSAG-Canada) : Typage moléculaire:

Sur cette page

• Typage par séquençage de plusieurs antigènes
• Raisons pour lesquelles nous surveillons le NG-MAST
• Publications relatives au NG-MAST
• Typage par séquençage pour la RAM
• Publications relatives au NG-STAR

Typage par séquençage de plusieurs antigènes

Le typage par séquençage de plusieurs antigènes (NG-MAST)^{Note de bas de page 1} est un outil précieux pour caractériser différentes souches de gonorrhée. Cette méthode implique le séquençage de 2 gènes :

• porine B (porB)
• protéine B liant la transferrine (tbpB)

Ensemble, ces gènes constituent la séquence type. Nous déterminons la séquence type en utilisant les Bases de données publiques sur le typage moléculaire (PubMLST).

Pourquoi nous surveillons le NG-MAST

La surveillance des séquences type nous aide à comprendre quelles sont les souches qui circulent dans les régions du Canada. Elle permet également d'appuyer les enquêtes sur les épidémies et les traitements inefficaces. De plus, les souches de gonorrhée qui présentent la même séquence type ont également des profils de RAM similaires ou identiques. Le typage NG-MAST est donc un outil de caractérisation utile pour la gonorrhée.

Figure 1. Répartition des séquences type NG-MAST les plus courantes au Canada en

Publications sur NG-MAST

• Rapid Sequence-Based Identification of Gonococcal Transmission Clusters in a Large Metropolitan Area (en anglais seulement)
• Increasing Azithromycin Resistance in Neisseria gonorrhoeae due to NG-MAST 12302 clonal spread in Canada, 2015 to 2018 (en anglais seulement)
• Non-cultural detection and molecular genotyping of Neisseria gonorrhoeae from a piece of clothing (en anglais seulement)

Typage de séquence pour la RAM

Nous utilisons également le typage de séquence de la gonorrhée pour la résistance aux antimicrobiens (NG-STAR)^{Note de bas de page 2}. Il s'agit d'un nouvel outil de typage de la résistance aux antimicrobiens basé sur les séquences. Il a été développé par le Laboratoire national de microbiologie (LNM) pour suivre la propagation mondiale des souches de N. gonorrhoeae.

Elle permet de classer 7 gènes bien caractérisés de N. gonorrhoeae (penA, mtrR, porB, ponA, gyrA et 23S rRNA). Ces gènes sont associés à la résistance à trois classes d'antimicrobiens (céphalosporines, macrolides, fluoroquinolones). Pour chaque souche de gonorrhée, un numéro d'allèle est attribué à chaque gène. La combinaison de ces numéros d'allèles constitue la séquence type.

Application Web NG-STAR

Figure 3. Répartition annuelle du type NG-STAR au Canada en année

Publications sur NG-STAR

• NG-STAR genotypes are associated with MDR in Neisseria gonorrhoeae isolates collected in 2017 in Shanghai (en anglais seulement)
• Emergence and spread of Neisseria gonorrhoeae clinical isolates harboring mosaic-like structure of penicillin-binding protein 2 in central Japan (en anglais seulement)
• Mutations in gyrA, gyrB, parC, and parE in quinolone-resistant strains of Neisseria gonorrhoeae (en anglais seulement)
• Mutation in 23S rRNA associated with macrolide resistance in Neisseria gonorrhoeae (en anglais seulement)
• Characterization of ciprofloxacin resistance in Neisseria gonorrhoeae isolates in Canada (en anglais seulement)
• Rapid sequence-based identification of gonococcal transmission clusters in a large metropolitan area (en anglais seulement)
• Multidrug-resistant strains of Neisseria gonorrhoeae in Greece (en anglais seulement)
• Mutations in ponA, the gene encoding penicillin-binding protein 1, and a novel locus, penC, are required for high-level chromosomally mediated penicillin resistance in Neisseria gonorrhoeae (en anglais seulement)

Références